RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 SPINT1O43278 529 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 BTCP35070 178 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 DUSP2Q05923 314 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 ADAM15Q13444 863 aa23.73■■□□□ 1.39
SENP3-201ENST00000321337 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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SENP3-201ENST00000321337 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.72■■□□□ 1.39
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SENP3-201ENST00000321337 TSPAN11A1L157 253 aa23.71■■□□□ 1.39
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF222Q9UK12 451 aa23.7■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 CHST2Q9Y4C5 530 aa23.7■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.7■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SHC1P29353 583 aa23.7■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 IRF7Q92985 503 aa23.7■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 NUDT15Q9NV35 164 aa23.7■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 SNTNA6NMZ2 147 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 TSPAN31Q12999 210 aa23.69■■□□□ 1.38
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SENP3-201ENST00000321337 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 C17orf62Q9BQA9 187 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 MED28Q9H204 178 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 MED20Q9H944 212 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TM7SF3Q9NS93 570 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 IRGMA1A4Y4 181 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 TBX19O60806 448 aa23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SENP3-201ENST00000321337 RFPL3O75679 317 aa23.69■■□□□ 1.38
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