RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 SLC16A6O15403 523 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KIAA0513O60268 411 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SOX30O94993 753 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 CCNB2O95067 398 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NKX2-2O95096 273 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 H1F0P07305 194 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 S1PR1P21453 382 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 AVPR2P30518 371 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SSTR4P31391 388 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PGDP52209 483 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 HMGA2P52926 109 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 BIKQ13323 160 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 APOFQ13790 326 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 C1orf189Q5VU69 101 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MED25Q71SY5 747 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC5A8Q8N695 610 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PRRC1Q96M27 445 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 FEVQ99581 238 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ARHGDIGQ99819 225 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 WFDC6Q9BQY6 131 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 IFT52Q9Y366 437 aa9.78□□□□□ -0.84
COPS2-201ENST00000299259 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 A6NHS1 94 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 HRKO00198 91 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PCDH17O14917 1159 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 UGT2B11O75310 529 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 THBS1P07996 1170 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GALNSP34059 522 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GABRA3P34903 492 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 EMDP50402 254 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SMIM11AP58511 58 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 KEAP1Q14145 624 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GPR68Q15743 365 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 EIPR1Q53HC9 387 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF691Q5VV52 312 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZNF836Q6ZNA1 936 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TCEAL3Q969E4 200 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FKBP10Q96AY3 582 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZG16BQ96DA0 208 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 VSTM2LQ96N03 204 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 OR6C1Q96RD1 312 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 POLE3Q9NRF9 147 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RLIMQ9NVW2 624 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 GXYLT2A0PJZ3 443 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 AGAP5A6NIR3 686 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 C17orf105B2RV13 164 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 D6RAR5 112 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FAAHO00519 579 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 CLPTM1O96005 669 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ATP6V1B1P15313 513 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 IL7RP16871 459 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FUT4P22083 530 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RPS6KA3P51812 740 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PSG6Q00889 435 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FUT7Q11130 342 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 NPTX1Q15818 432 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 LIN52Q52LA3 116 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 PHF19Q5T6S3 580 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 SETD9Q8NE22 299 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.77□□□□□ -0.85
COPS2-201ENST00000299259 TSLPQ969D9 159 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms