RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 CHRNA6Q15825 494 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CCL14Q16627 93 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 VASNQ6EMK4 673 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 OR5M10Q6IEU7 315 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM107Q6UX40 140 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FGF11Q92914 225 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SMIM14Q96QK8 99 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MYNNQ9NPC7 610 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ICKQ9UPZ9 632 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ANGPT4Q9Y264 503 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 A0A1W2PQ09 198 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FAM74A7A6NL05 159 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CBX4O00257 560 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FAAHO00519 579 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 GPR171O14626 319 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 YY2O15391 372 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CSO75390 466 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 DIRAS1O95057 198 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PRAMEF12O95522 483 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CBX7O95931 251 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 RLN2P04090 185 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CBR1P16152 277 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CCR7P32248 378 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SGSHP51688 502 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SEMG2Q02383 582 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFA9Q16795 377 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SGO1Q5FBB7 561 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PAMR1Q6UXH9 720 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF280BQ86YH2 543 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 AP3S1Q92572 193 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MYOCQ99972 504 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 LRRK1Q38SD2 2015 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 STX11O75558 287 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 KLKB1P03952 638 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CTSHP09668 335 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 LAMP1P11279 417 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PPP3R1P63098 170 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 B4GALNT1Q00973 533 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 BCL2L1Q07817 233 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CRHR2Q13324 411 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SCARB2Q14108 478 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 VEPH1Q14D04 833 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MPEG1Q2M385 716 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 C3orf38Q5JPI3 329 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 DNLZQ5SXM8 178 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 Q6ZNB5 142 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 MRGPREQ86SM8 312 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 LNX2Q8N448 690 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 OR56A3Q8NH54 315 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 C14orf144Q96I85 54 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 COPS8Q99627 209 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 JAM3Q9BX67 310 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 RRAGCQ9HB90 399 aa5.94□□□□□ -1.46
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms