RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033012.8

Copb1-201, Transcript of Coatomer subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Copb1, Length 3,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mtch2Q791V5 303 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr1045Q7TR80 315 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Siglec10Q80ZE3 688 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc36a2Q8BHK3 478 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Fbxo44Q8BK26 255 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Stfa2l1Q8BWM3 103 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mmp21Q8K3F2 568 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr170Q8VGL6 313 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Oasl1Q8VI94 511 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sntb1Q99L88 537 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Acad8Q9D7B6 413 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dusp6Q9DBB1 381 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pcm1Q9R0L6 2025 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Col11a1Q61245 1804 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zfp985A2A7A5 519 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 CatsperbA2RTF1 1109 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tex54G3UW99 86 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r12L7N217 831 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 ChrndP02716 520 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Il7rP16872 459 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Yap1P46938 488 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rap2bP61226 183 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Eef1a2P62631 463 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 HpQ61646 347 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Lrfn2Q80TG9 788 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pnma8aQ80VM8 430 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rxfp3Q8BGE9 472 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Leng9Q8BTN6 485 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Yipf4Q8C407 246 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Micu2Q8CD10 432 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Galnt18Q8K1B9 622 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr1284Q8VF29 311 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 DcxrQ91X52 244 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gjd3Q91YD1 278 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tspan31Q9CQ88 210 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mpc2Q9D023 127 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Wdr20Q9D5R2 567 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Prl5a1Q9JII2 230 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mrpl39Q9JKF7 336 aa9.5□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm14781A2A9Q9 366 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gm20547B8JJN0 1276 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 MaffO54791 156 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 H2-T23P06339 357 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zfp28P10078 825 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rag2P21784 527 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Htr3aP23979 487 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Bmi1P25916 324 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cyp2c37P56654 490 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Wdr5P61965 334 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Smpd1Q04519 627 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mageb5Q14AN0 366 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sap25Q1EHW4 186 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Taar7dQ5QD10 358 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mon1aQ6PDG8 556 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr389Q7TRX7 312 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mal2Q8BI08 175 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Nipal1Q8BMW7 416 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vps9d1Q8C190 649 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Phf21bQ8C966 487 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Slc35e1Q8CD26 409 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cmtm4Q8CJ61 208 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pnpla8Q8K1N1 776 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 WwoxQ91WL8 414 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tmem51Q99LG1 249 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Gkn2Q9CQS6 184 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Q9CQT6 229 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Mfsd2aQ9DA75 534 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Hoga1Q9DCU9 321 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 HcstQ9QUJ0 79 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 ReckQ9Z0J1 971 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 AccsA2AIG8 502 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Fnd3c2A2AP83 941 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ralgps1A2AR50 585 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Olfr564E9PWA8 316 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Vmn2r114E9Q281 856 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Rem1O35929 297 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 P01851 173 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 P01852 173 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 HexbP20060 536 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 CebpbP28033 296 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cdh4P39038 913 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 TstP52196 297 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pnpla5Q32LZ8 432 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ankrd53Q3V0J4 497 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Ptpn21Q62136 1176 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tgfbr2Q62312 592 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Klhl5Q6PFE1 708 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Pgr15lQ80T54 456 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cdadc1Q8BMD5 523 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Cd300eQ8K249 196 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa9.49□□□□□ -0.89
Copb1-201ENSMUST00000033012 Anapc10Q8K2H6 185 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.3 ms