RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	PRKAG1	P54619	331 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR4D2	P58180	307 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DSTN	P60981	165 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DCAF7	P61962	342 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PSPH	P78330	225 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CDC20	Q12834	499 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FLOT2	Q14254	428 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SSPN	Q14714	243 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CYP51A1	Q16850	503 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	COX20	Q5RI15	118 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AAGAB	Q6PD74	315 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	EID3	Q8N140	333 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C10orf111	Q8N326	155 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TSLP	Q969D9	159 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CRB3	Q9BUF7	120 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR10A5	Q9H207	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR51I1	Q9H343	314 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CALML5	Q9NZT1	146 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	KCND3	Q9UK17	655 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.87	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CXCR6	O00574	342 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	GSTA4	O15217	222 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	NKX2-8	O15522	239 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ENTPD5	O75356	428 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	NKX2-2	O95096	273 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C1QC	P02747	245 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MMP11	P24347	488 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	KDELR2	P33947	212 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SLC37A1	P57057	533 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	AP2B1	P63010	937 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CDK6	Q00534	326 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	REEP3	Q6NUK4	255 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF605	Q86T29	641 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HIPK4	Q8NE63	616 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	LPAR4	Q99677	370 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ARPC2	O15144	300 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CREG1	O75629	220 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	DDAH2	O95865	285 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	IFNA14	P01570	189 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	CLPS	P04118	112 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	UMOD	P07911	640 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	ALOX5	P09917	674 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	NUDT7	P0C024	238 aa		11.85	□□□□□ -0.51
CELF4-222	ENST00000601392	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.85	□□□□□ -0.51

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