RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3R3Q92569 461 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CHFRQ96EP1 664 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP19Q96LK0 163 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MGLLQ99685 303 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 FUZQ9BT04 418 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SERHL2Q9H4I8 314 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SP140LQ9H930 580 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 AMBNQ9NP70 447 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB4Q9Y574 426 aa8.65□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CKAP5Q14008 2032 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A075B6Q4 140 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0G2JN53 185 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PR48 441 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS38A1L453 326 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR23AA6NEV1 266 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R3H8 397 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 AP3D1O14617 1153 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 B4GALT2O60909 372 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX14O95416 240 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LGI1O95970 557 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FUCA1P04066 466 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXB2P14652 356 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CERS1P27544 350 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAG1P54619 331 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFRSF17Q02223 184 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RELAQ04206 551 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF91Q05481 1191 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RUNX1T1Q06455 604 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ST3GAL3Q11203 375 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FGL2Q14314 439 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC23BQ15437 767 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CEBPEQ15744 281 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPK11Q15759 364 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF311Q5JNZ3 666 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PERM1Q5SV97 790 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF425Q6IV72 752 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf94Q6P1W5 598 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM107Q6UX40 140 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ABHD13Q7L211 337 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RRM2BQ7LG56 351 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCHQ86VS3 1027 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PAQR7Q86WK9 346 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC34A3Q8N130 599 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 NUP43Q8NFH3 380 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR4K5Q8NGD3 323 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 PIGXQ8TBF5 258 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RFKQ969G6 155 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR92Q96MX6 357 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM210AQ96ND0 272 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SERINC2Q96SA4 455 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGDIGQ99819 225 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC32Q9BV29 185 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.64□□□□□ -1.03
EFTUD2-222ENST00000592408 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms