RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 A8MUA0 341 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CLOCKO15516 846 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PRSS23O95084 383 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DDAH2O95865 285 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 LDLRP01130 860 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV3-11P04433 115 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 VLDLRP98155 873 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP7Q16829 419 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 C16orf52Q8NHV5 167 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 LZICQ8WZA0 190 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NTN4Q9HB63 628 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CALML5Q9NZT1 146 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa24.2■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK4P11802 303 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 LIMK1P53667 647 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRNEQ04844 493 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF321PQ8N8H1 164 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3R3Q92569 461 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF25A6NGN4 478 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PEX1O43933 1283 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FCMRO60667 390 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC37A1P57057 533 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM198BQ6UWH4 519 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FRRS1Q6ZNA5 592 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT73Q86Y46 540 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ARMC8Q8IUR7 673 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 COX18Q8N8Q8 333 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR32P1Q8NGA4 272 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 OR14A16Q8NHC5 309 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC2A12Q8TD20 617 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR151Q8TDV0 419 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TAAR9Q96RI9 348 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SDF2Q99470 211 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZPBPQ9BS86 351 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DDA1Q9BW61 102 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR54Q9H977 334 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PISDQ9UG56 409 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCG2Q9UNQ0 655 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa24.19■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC187A0A096LP49 1063 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SERPINB7O75635 380 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FABP3P05413 133 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 HEXBP07686 556 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GABRA3P34903 492 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 IFI44LQ53G44 452 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DCST2Q5T1A1 773 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF721Q8TF20 911 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHL4Q9C0H6 718 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF350Q9GZX5 532 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJB9Q9UBS3 223 aa24.18■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GXYLT2A0PJZ3 443 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PLD2O14939 933 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DYRK3O43781 588 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SOX30O94993 753 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CST1P01037 141 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 JMJD7P0C870 316 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TNFRSF1BP20333 461 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNJ5P48544 419 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP27C1Q4G0S4 372 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CCNJQ5T5M9 372 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NPSR1Q6W5P4 371 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 EPHX4Q8IUS5 362 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ICA1LQ8NDH6 482 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 MR1Q95460 341 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZG16BQ96DA0 208 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 BDH2Q9BUT1 245 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 OR8D2Q9GZM6 311 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SEC14L3Q9UDX4 400 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 C3orf18Q9UK00 162 aa24.17■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 hCG_2039718K7EN88 272 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ALOX12BO75342 701 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 RASSF5Q8WWW0 418 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PHOX2BQ99453 314 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CIB1Q99828 191 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 MESP1Q9BRJ9 268 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 VCX3BQ9H321 246 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 BAG5Q9UL15 447 aa24.16■■□□□ 1.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa24.16■■□□□ 1.46
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