RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 GPR143P51810 404 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 LAPTM5Q13571 262 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PWP1Q13610 501 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SQLEQ14534 574 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 CHRFAM7AQ494W8 412 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 XKR6Q5GH73 641 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 Q6ZSR9 355 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 NSL1Q96IY1 281 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 C3orf30Q96M34 536 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 KCNA7Q96RP8 456 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 TRIB1Q96RU8 372 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 GSX2Q9BZM3 304 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 BRF2Q9HAW0 419 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 TAGLN3Q9UI15 199 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.52□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 TIMM22Q9Y584 194 aa8.52□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 CFAP73A6NFT4 308 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 UBE2E3Q969T4 207 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 CDK15Q96Q40 435 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 FRG2BQ96QU4 278 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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