RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 KCNC2Q96PR1 638 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 NODALQ96S42 347 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CALHM2Q9HA72 323 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SERHLQ9NQF3 203 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.16□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 A0A088AWK7 358 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 H0Y3Z8 333 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 H0YC42 278 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 HCRTR2O43614 444 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 RCBTB2O95199 551 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 AIFM1O95831 613 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CNTFP26441 200 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 GSTM2P28161 218 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SERPINB3P29508 390 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 GFRA1P56159 465 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CLDN15P56746 228 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CLDN18P56856 261 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 GPX6P59796 221 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CAV1Q03135 178 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 DUSP2Q05923 314 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 STEAP4Q687X5 459 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ZNF615Q8N8J6 731 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SNX31Q8N9S9 440 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 RDH11Q8TC12 318 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD7Q92527 254 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CAVIN3Q969G5 261 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 PIGTQ969N2 578 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 STARD4Q96DR4 205 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CFAP36Q96G28 342 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 OR51B5Q9H339 312 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 EHD1Q9H4M9 534 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 CAB39LQ9H9S4 337 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 WWOXQ9NZC7 414 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 EHD3Q9NZN3 535 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 VWA7Q9Y334 891 aa7.15□□□□□ -1.26
RD3L-201ENST00000557640 A0A0A6YYD5 115 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 A0A1W2PR48 441 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 PLOD2O00469 737 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 NME6O75414 186 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 CGAP01215 116 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 TUBBP07437 444 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 CYP4B1P13584 511 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 COX7A2P14406 83 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 CPN1P15169 458 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 PAX1P15863 534 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 S1PR1P21453 382 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 GPX3P22352 226 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 ABCD3P28288 659 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 GGT5P36269 586 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 UGT2B10P36537 528 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 MC3RP41968 323 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 ELK3P41970 407 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 MASP1P48740 699 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 HNMTP50135 292 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 SIRPAP78324 504 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 DMTNQ08495 405 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 CALCOCO2Q13137 446 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 CHIT1Q13231 466 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 SLAMF1Q13291 335 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 TOMM20Q15388 145 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 PDK4Q16654 411 aa7.14□□□□□ -1.27
RD3L-201ENST00000557640 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms