RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SGCAQ16586 387 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 IL26Q9NPH9 171 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 G3V2L1 256 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 SCO2O43819 266 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 LHCGRP22888 699 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 RAB8BQ92930 207 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-208ENST00000550358 CPNE7Q9UBL6 633 aa8.05□□□□□ -1.12
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