RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516614.1

RNU6-229P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 229, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-229P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-229P-201ENST00000516614 GCNT1Q02742 428 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 GBE1Q04446 702 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 INCA1Q0VD86 236 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CETN1Q12798 172 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZP4Q12836 540 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KIF5AQ12840 1032 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 STX4Q12846 297 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 DLG1Q12959 904 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 NPRL3Q12980 569 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZBTB17Q13105 803 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KLRD1Q13241 179 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 NAE1Q13564 534 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC12A1Q13621 1099 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 PKP1Q13835 747 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RUNX2Q13950 521 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TRIM14Q14142 442 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RCAN2Q14206 197 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SQLEQ14534 574 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 IHHQ14623 411 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KIR2DS5Q14953 304 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 NAA25Q14CX7 972 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 HEPACAMQ14CZ8 416 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RASA2Q15283 850 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 HSPB2Q16082 182 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CNGA2Q16280 664 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 PHKG1Q16816 387 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 NDUFAF6Q330K2 333 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMEM95Q3KNT9 176 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC25A52Q3SY17 297 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRT71Q3SY84 523 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF260Q3ZCT1 412 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 DEFB134Q4QY38 66 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRTCAP3Q53RY4 240 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF628Q5EBL2 1059 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RILPL1Q5EBL4 403 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CT83Q5H943 113 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RAB41Q5JT25 222 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 EFHC1Q5JVL4 640 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SIRPB2Q5JXA9 342 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SPATA46Q5T0L3 261 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 DCAF12L2Q5VW00 463 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 AGAP6Q5VW22 663 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SNX30Q5VWJ9 437 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RAET1LQ5VY80 246 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 OTPQ5XKR4 325 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CARD17Q5XLA6 110 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC22A10Q63ZE4 541 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ICE2Q659A1 982 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ATL3Q6DD88 541 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 PM20D1Q6GTS8 502 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ADNP2Q6IQ32 1131 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRT80Q6KB66 452 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TTI2Q6NXR4 508 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 AADACL2Q6P093 401 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 C1orf94Q6P1W5 598 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 NEK5Q6P3R8 708 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CASC4Q6P4E1 433 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TTC23LQ6PF05 361 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 BRAT1Q6PJG6 821 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SCIMPQ6UWF3 145 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SBSNQ6UWP8 590 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 B3GLCTQ6Y288 498 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CLEC17AQ6ZS10 378 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 CCDC121Q6ZUS5 278 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 RFX8Q6ZV50 586 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SH2D5Q6ZV89 423 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 UNC13DQ70J99 1090 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 MON1BQ7L1V2 547 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 BEND5Q7L4P6 421 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC29A4Q7RTT9 530 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-229P-201ENST00000516614 OLIG3Q7RTU3 272 aa0.47□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms