RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TAC1P20366 129 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 HMOX2P30519 316 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CORO7P57737 925 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SORDQ00796 357 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 LGSNQ5TDP6 509 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 IFNEQ86WN2 208 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SLC35A4Q96G79 324 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 BTBD9Q96Q07 612 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TMEM237Q96Q45 408 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TM9SF2Q99805 663 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ACPTQ9BZG2 426 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TAS2R10Q9NYW0 307 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 FBXL2Q9UKC9 423 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 DOCK7Q96N67 2140 aa15.37■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MPDZO75970 2070 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CLCA1A8K7I4 914 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PCDH7O60245 1069 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TSPAN2O60636 221 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ABCB7O75027 752 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ERN1O75460 977 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 RCBTB2O95199 551 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GCAP28676 217 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SRD5A2P31213 254 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 HTR6P50406 440 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GFRA1P56159 465 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 LUZP2Q86TE4 346 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ERP27Q96DN0 273 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 APIPQ96GX9 242 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 VSTM2LQ96N03 204 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ALPK1Q96QP1 1244 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 G6PC3Q9BUM1 346 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SFXN3Q9BWM7 321 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.36■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 RAF1P04049 648 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 IMPDH1P20839 514 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KRT20P35900 424 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 LHX2P50458 406 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ACSM2AQ08AH3 577 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SPIN4Q56A73 249 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ACSM2BQ68CK6 577 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GCNT2Q8N0V5 402 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 OR4N2Q8NGD1 307 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZNF592Q92610 1267 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 WNT2BQ93097 391 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MBD6Q96DN6 1003 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 MTBPQ96DY7 904 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 POM121Q96HA1 1249 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SFXN2Q96NB2 322 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZFP3Q96NJ6 502 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 UCN2Q96RP3 112 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KCNA7Q96RP8 456 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP4Q9NUV9 329 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GALNT8Q9NY28 637 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CLCF1Q9UBD9 225 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 DKKL1Q9UK85 242 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TIMM22Q9Y584 194 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 NF1P21359 2839 aa15.35■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ZFHX3Q15911 3703 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PLOD2O00469 737 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ATE1O95260 518 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CTAGE8P0CG41 777 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GRK2P25098 689 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 IL12BP29460 328 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CPA2P48052 419 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 PNLIPRP2P54317 469 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 CLDN18P56856 261 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 ADAM8P78325 824 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 BTKQ06187 659 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KEAP1Q14145 624 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 EFR3AQ14156 821 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 HEPACAMQ14CZ8 416 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 POU4F3Q15319 338 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 AAGABQ6PD74 315 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SCIMPQ6UWF3 145 aa15.34■□□□□ 0.05
HERC3-211ENST00000513325 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms