RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	BTBD9	Q96Q07	612 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FRG2C	A6NGY1	282 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SDHD	O14521	159 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	T	O15178	435 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACOX3	O15254	700 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPM1B	O75688	479 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PDE9A	O76083	593 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSMG1	O95456	288 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	STS	P08842	583 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	HPCAL1	P37235	193 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TESK1	Q15569	626 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	SMU1	Q2TAY7	513 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ATG16L1	Q676U5	607 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	GK5	Q6ZS86	529 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR2L13	Q8N349	312 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	DIO2	Q92813	273 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	HGD	Q93099	445 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMBIM1	Q969X1	311 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NODAL	Q96S42	347 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	ASIC5	Q9NY37	505 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	CNIH4	Q9P003	139 aa		14.53	□□□□□ -0.08
PRKCZ-222	ENST00000496325	TP53I11	O14683	189 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	COQ9	O75208	318 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	UGT2B11	O75310	529 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLITRK5	O94991	958 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NAGA	P17050	411 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GPC1	P35052	558 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAGEA5	P43359	124 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CLDN8	P56748	225 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KCNJ2	P63252	427 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PSG6	Q00889	435 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GHDC	Q8N2G8	530 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NTNG2	Q96CW9	530 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	COQ8B	Q96D53	544 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TACC2	O95359	2948 aa		14.52	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1B0GTH9	108 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KLF11	O14901	512 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HDAC3	O15379	428 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TSPAN2	O60636	221 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC19A2	O60779	497 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	REM1	O75628	298 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CELA3A	P09093	270 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LBP	P18428	481 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRPS1L1	P21108	318 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PTGDS	P41222	190 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CASP3	P42574	277 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C3AR1	Q16581	482 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CPTP	Q5TA50	214 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FJX1	Q86VR8	437 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RILP	Q96NA2	401 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DOHH	Q9BU89	302 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		14.51	□□□□□ -0.09

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