RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 KLHL35Q6PF15 583 aa15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 FRRS1Q6ZNA5 592 aa15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 IQCHQ86VS3 1027 aa15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 OR4K5Q8NGD3 323 aa15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 TANKQ92844 425 aa15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOM1-216ENST00000492723 WDR45Q9Y484 360 aa15.65■□□□□ 0.1
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TOM1-216ENST00000492723 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 SLC38A3Q99624 504 aa15.64■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 STX19Q8N4C7 294 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 MORN4Q8NDC4 146 aa15.63■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 SIX5Q8N196 739 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 LINC00471Q8N535 108 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 YIPF6Q96EC8 236 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 PIGUQ9H490 435 aa15.63■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 70.3
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TOM1-216ENST00000492723 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 CHST10O43529 356 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 PLOD3O60568 738 aa15.62■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 OCA2Q04671 838 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 ST3GAL4Q11206 333 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 GPR68Q15743 365 aa15.62■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 SDF2Q99470 211 aa15.62■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF232Q9UNY5 417 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WV62 115 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 CLDN24A6NM45 220 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 SDC3O75056 442 aa15.62■□□□□ 0.09
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TOM1-216ENST00000492723 ALOX5P09917 674 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 CT62P0C5K7 136 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 STARD6P59095 220 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 UBE2UQ5VVX9 321 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 CASP12Q6UXS9 341 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.62■□□□□ 0.09
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