RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NELFE-209ENST00000488426 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
NELFE-209ENST00000488426 STACQ99469 402 aa11.85□□□□□ -0.51
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