RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465905.5

TRAPPC10-206, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-206ENST00000465905 SPNS3Q6ZMD2 512 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 CCDC63Q8NA47 563 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 ZPLD1Q8TCW7 415 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC10-206ENST00000465905 MZB1Q8WU39 189 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 VSTM2LQ96N03 204 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 OR2B2Q9GZK3 357 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 OR10H1Q9Y4A9 318 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-206ENST00000465905 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 G3V2L1 256 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 CD1EP15812 388 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 NTSP30990 170 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 SRD5A2P31213 254 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 CORO7P57737 925 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 DNAJB13P59910 316 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 DCST1Q5T197 706 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 AAGABQ6PD74 315 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 TRIM42Q8IWZ5 723 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 RDH11Q8TC12 318 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 FAM222BQ8WU58 562 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 MID2Q9UJV3 735 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 DKKL1Q9UK85 242 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC10-206ENST00000465905 FAM71E1Q6IPT2 247 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 IKBIPQ70UQ0 350 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 TDRPQ86YL5 185 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 OR4K17Q8NGC6 315 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 SFXN2Q96NB2 322 aa11.63□□□□□ -0.55
TRAPPC10-206ENST00000465905 TM9SF2Q99805 663 aa11.63□□□□□ -0.55
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