RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439475.1

MCF2L-216, Transcript of MCF.2 cell line derived transforming sequence like, humanhuman

TSL 5

Gene MCF2L, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L-216ENST00000439475 TOMM20Q15388 145 aa9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.876e-15■■■□□ 19
MCF2L-216ENST00000439475 DECR1Q16698 335 aa9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 CYP27C1Q4G0S4 372 aa9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 GXYLT1Q4G148 440 aa9.6□□□□□ -0.87
MCF2L-216ENST00000439475 CT45A2Q5DJT8 189 aa9.6□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 SLC35A4Q96G79 324 aa9.6□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 A0A1W2PRS3 328 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 UGT2B11O75310 529 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 SOX30O94993 753 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 RNF224P0DH78 156 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 SZRD1Q7Z422 152 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 CHST11Q9NPF2 352 aa9.59□□□□□ -0.87
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MCF2L-216ENST00000439475 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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MCF2L-216ENST00000439475 BST1Q10588 318 aa9.58□□□□□ -0.88
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MCF2L-216ENST00000439475 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
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