RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 GHRLQ9UBU3 117 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO6Q9UM54 1294 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IQGAP1P46940 1657 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.13□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PHLPP1O60346 1717 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 A2ML1A8K2U0 1454 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 DUX1O43812 170 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NXPH2O95156 264 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN12O95859 305 aa4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 FAM157CP0CG43 387 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAR1AP10644 381 aa4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 AADACP22760 399 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC25AP30304 524 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 BACE1P56817 501 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CARD18P57730 90 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NOP14P78316 857 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 GPR17Q13304 367 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TFDP1Q14186 410 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK6Q16659 721 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HAGHQ16775 308 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 STEAP1BQ6NZ63 245 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR142Q7Z601 462 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PIM3Q86V86 326 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC38A6Q8IZM9 456 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF441Q8N8Z8 693 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF383Q8NA42 475 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 M1APQ8TC57 530 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TMED6Q8WW62 240 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM3CQ92520 227 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 UPRTQ96BW1 309 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ELMO2Q96JJ3 720 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 C7orf34Q96L11 122 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf66Q96MD2 445 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 AGAP3Q96P47 875 aa4.12□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 XKR8Q9H6D3 395 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 POT1Q9NUX5 634 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KLRF1Q9NZS2 232 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GNG12Q9UBI6 72 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA3Q08378 1498 aa4.11□□□□□ -1.75
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CBX1P4-201ENST00000439415 IMPA2O14732 288 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF9O43307 516 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH16O75309 829 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 UPK3AO75631 287 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 OTCP00480 354 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT6AP02538 564 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 OPN1LWP04000 364 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 NR3C1P04150 777 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8G3PP0DMU2 310 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXD10P28358 340 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCG1P45844 678 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LBX1P52954 281 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 BTG1P62324 171 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 STK11Q15831 433 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM106AQ4KMX7 169 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90B2PQ58FF3 399 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO48Q5FWF7 155 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.11□□□□□ -1.75
CBX1P4-201ENST00000439415 LEG1Q6P5S2 330 aa4.11□□□□□ -1.75
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