RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR14I1A6ND48 311 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTC36A6NLP5 189 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCKDKO14874 412 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNHIT1O43257 154 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SUSD5O60279 629 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HCN1O60741 890 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF224P0DH78 156 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRPS1L1P21108 318 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARRB2P32121 409 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GCKP35557 465 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CASP3P42574 277 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLK3P49761 638 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRKAG1P54619 331 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CORO7P57737 925 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNTA1Q13424 505 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MPP2Q14168 576 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VPS26BQ4G0F5 336 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WLSQ5T9L3 541 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPTPQ5TA50 214 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 XKRXQ6PP77 449 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRILQ7L0X0 811 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR1J4Q8NGS1 313 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C3orf30Q96M34 536 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VSTM2LQ96N03 204 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADOQ96SZ5 270 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OSBPL11Q9BXB4 747 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MEMO1Q9Y316 297 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EXPH5Q8NEV8 1989 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1W2PRB8 838 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRAMEF25A6NGN4 478 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 E9PLN8 166 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UPK1AO00322 258 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AQP7O14520 342 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNB5O14775 395 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UGT2B11O75310 529 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNH1O95259 989 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IGHG3P01860 377 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFI6P09912 130 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CT45A8P0DMV1 189 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CT45A9P0DMV2 189 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOX18P35713 384 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RFX3P48380 749 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC18A1P54219 525 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PNLIPRP2P54317 469 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR5P85299 388 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EMX2Q04743 252 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BST1Q10588 318 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDE7AQ13946 482 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTGR1Q14914 329 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DECR1Q16698 335 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SMU1Q2TAY7 513 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP27C1Q4G0S4 372 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BICRALQ6AI39 1079 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C3P1Q6ZMU1 363 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OR2L13Q8N349 312 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NUP43Q8NFH3 380 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HGDQ93099 445 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM41AQ96HV5 264 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHF12Q96QT6 1004 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 VKORC1Q9BQB6 163 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PROK2Q9HC23 129 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EQTNQ9NQ60 294 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THAP1Q9NVV9 213 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A1B0GVC2 190 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFLARO15519 480 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EMC8O43402 210 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ICOSLGO75144 302 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms