RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.08□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KALRNO60229 2985 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX2-2O95096 273 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX4O95219 450 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCL3P10147 92 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EDN3P14138 238 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K8P41279 467 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKAG1P54619 331 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CORO7P57737 925 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNTA1Q13424 505 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFR3AQ14156 821 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NNATQ16517 81 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SZRD1Q7Z422 152 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMCO6Q96DC7 493 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX37Q96LM6 180 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STACQ99469 402 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS4AQ9UN37 437 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.07□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM234BA2RU67 622 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POM121CA8CG34 1229 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 J3QKU1 62 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNH1O95259 989 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF24P17028 368 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL12AP29459 219 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL12BP29460 328 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCN1P31025 176 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEOX1P50221 254 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNLIPRP2P54317 469 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NME5P56597 212 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXW4P57775 412 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DECR1Q16698 335 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2M7Q8NG81 312 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4A15Q8NGL6 344 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT8Q8WV74 236 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HGDQ93099 445 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMBIM1Q969X1 311 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RILPQ96NA2 401 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL21A1Q96P44 957 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR52E6Q96RD3 313 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RMND5AQ9H871 391 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBLCQ9ULV8 474 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.06□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JND7 137 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACOT7O00154 380 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN2O60636 221 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 REM1O75628 298 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALOX5P09917 674 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UQCRC2P22695 453 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGAP37287 484 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHC1P78364 1004 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAB1Q13480 694 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53BP2Q13625 1128 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SQLEQ14534 574 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDC73Q6P1J9 531 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR22Q8IZ63 422 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR151Q8TDV0 419 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIO2Q92813 273 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARK4Q96L34 752 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PANX1Q96RD7 426 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DOHHQ9BU89 302 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGUQ9H490 435 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HHATLQ9HCP6 504 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EQTNQ9NQ60 294 aa14.05□□□□□ -0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEPPQ9NTK1 212 aa14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms