RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 ALG9Q9H6U8 611 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPS4Q9NQG7 708 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PNPLA3Q9NST1 481 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NARFQ9UHQ1 456 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF175Q9Y473 711 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX5Q9Y5X3 404 aa1.95□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDC3O75056 442 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CA11O75493 328 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP3O75969 853 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGSF6O95976 241 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NF2P35240 595 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBMXP38159 391 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRR4Q16378 134 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAMK4Q16566 473 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SGCBQ16585 318 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 AARDQ4LEZ3 155 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLRA4Q5JXX5 417 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARMC3Q5W041 872 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q6P435 159 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM270Q6UE05 265 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PP632Q6XCG6 107 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 B3GLCTQ6Y288 498 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC22A16Q86VW1 577 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf40Q8IXQ3 194 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 MLKLQ8NB16 471 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR10H4Q8NGA5 316 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM37Q8WXS4 190 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 DEFB118Q96PH6 123 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM213AQ9BRX8 229 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TM2D1Q9BX74 207 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 FUT8Q9BYC5 575 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NLNQ9BYT8 704 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLT8D2Q9H1C3 349 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABCG8Q9H221 673 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CARD9Q9H257 536 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTGES2Q9H7Z7 377 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLK12Q9UKR0 248 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 DHRS7Q9Y394 339 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEGF6O75095 1541 aa1.94□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRD1A4D1F6 860 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRIT2A6NDA9 550 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSPH10B2B2RC85 870 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPIPA2E9PIF3 369 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTN2O75298 545 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSPH10BP0C881 870 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 VDRP11473 427 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SDC1P18827 310 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 GABRR1P24046 479 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPY2RP49146 381 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF45Q02386 682 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDE7AQ13946 482 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC14Q49A88 953 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMPK2Q5EBM0 449 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 IRGCQ6NXR0 463 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 BNIPLQ7Z465 357 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CENPSQ8N2Z9 138 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD49Q8WVL7 239 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 P3H4Q92791 437 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPAN18Q96SJ8 248 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC5A7Q9GZV3 580 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRPV6Q9H1D0 765 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 NANOGQ9H9S0 305 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELOVL2Q9NXB9 296 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 LHX3Q9UBR4 397 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 COPS7AQ9UBW8 275 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF221Q9UK13 617 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 FKBP7Q9Y680 259 aa1.93□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP6P35125 1406 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PTPRUQ92729 1446 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf51A6NDU8 294 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC7A4O43246 635 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF254O75437 659 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 TGDSO95455 350 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGK2P07205 417 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF18P17022 549 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 PITPNBP48739 271 aa1.92□□□□□ -2.1
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAV2P51636 162 aa1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms