RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 RNF208Q9H0X6 261 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 BEX1Q9HBH7 125 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 TUBAL3A6NHL2 446 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 LIMS3P0CW19 117 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 LIMS4P0CW20 117 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2ADP20671 130 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 LCN1P31025 176 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 ERVK-21P61565 698 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 LRRC74AQ0VAA2 488 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 GINS1Q14691 196 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 CDKN3Q16667 212 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 ACSM5Q6NUN0 579 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 RASGRP3Q8IV61 690 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 GIMAP1Q8WWP7 306 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 VWCEQ96DN2 955 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 ASIC4Q96FT7 647 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 COPS3Q9UNS2 423 aa15.84■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.83■□□□□ 0.13
GDE1-201ENST00000353258 SERTM1A2A2V5 107 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TEX46H3BTG2 121 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MMP20O60882 483 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 IGSF6O95976 241 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DPB1P04440 258 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZP1P60852 638 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR4K3Q96R72 315 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CD84Q9UIB8 345 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 F8A1P23610 371 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SPAM1P38567 509 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CCR6P51684 374 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ERVFC1P60507 584 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN5P62079 268 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OPCMLQ14982 345 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 DEF8Q6ZN54 512 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 STPG2Q8N412 459 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SCRN2Q96FV2 425 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SFXN2Q96NB2 322 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FAM8A1Q9UBU6 413 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 POMT2Q9UKY4 750 aa15.83■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 POM121CA8CG34 1229 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 KRBOX1C9JBD0 128 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FAAHO00519 579 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 FKTNO75072 461 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ARAFP10398 606 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ACP2P11117 423 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SOAT1P35610 550 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 MMP12P39900 470 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SELENOPP49908 381 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 DOC2AQ14183 400 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GSG1Q2KHT4 349 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF687Q8N1G0 1237 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 NXPE1Q8N323 547 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 C12orf66Q96MD2 445 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 DDOQ99489 341 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GLS2Q9UI32 602 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 GPR52Q9Y2T5 361 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 COL4A6Q14031 1691 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 ZNF98A6NK75 572 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 OLFM2O95897 454 aa15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
GDE1-201ENST00000353258 SERPINA4P29622 427 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms