RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 B4GALT7Q9UBV7 327 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA1CQ13936 2221 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM120BA0PK00 339 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6C70A6NIJ9 312 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPA2E9PIF3 369 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPA3F8WFD2 350 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP7O14520 342 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN2O60636 221 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRK2P25098 689 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRKP42685 505 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSPHP78330 225 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSG6Q00889 435 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGR1Q14914 329 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC10A1Q14973 349 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM198Q66K66 360 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTERF3Q96E29 417 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM41AQ96HV5 264 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 OSBPL11Q9BXB4 747 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC6A15Q9H2J7 730 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBQLN3Q9H347 655 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMBIM4Q9HC24 238 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAO1Q9UJM8 370 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 C15orf41Q9Y2V0 281 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP2CQ9Y3L5 183 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR14I1A6ND48 311 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUSD5O60279 629 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 HCN1O60741 890 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDF1P27539 372 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPCAL1P37235 193 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC1A6P48664 564 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 MASP1P48740 699 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAN2A2P49641 1150 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PACS2Q86VP3 889 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARVELD2Q8N4S9 558 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNDC5Q8NAU1 212 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP28Q8NHY6 868 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLCD1Q96CP7 247 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBGCP3Q96CW5 907 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL21A1Q96P44 957 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDAHQ9H6V9 325 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNT9Q9HCQ5 603 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACKR4Q9NPB9 350 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA3Q9NST1 481 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V1HQ9UI12 483 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCKDKO14874 412 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB7O75027 752 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 REM1O75628 298 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK9P50750 372 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 BST1Q10588 318 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASP8Q14790 479 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 HHATQ5VTY9 493 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL23RQ5VWK5 629 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC30A6Q6NXT4 461 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EID3Q8N140 333 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPRMLQ8N4K4 120 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADOQ96SZ5 270 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLRF1Q9NZS2 232 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPEQ02224 2701 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNB5O14775 395 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNPHO15079 494 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICOSLGO75144 302 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 HPNP05981 417 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPS2P11908 318 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP20933 346 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPN6P29350 595 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL12BP29460 328 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPC1P35052 558 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPC1P48995 793 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPL14P50914 215 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMSP52788 366 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX3Q13277 289 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNTA1Q13424 505 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 ART3Q13508 389 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFR3AQ14156 821 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDSNQ15517 529 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRCAP-201ENST00000326294 GXYLT1Q4G148 440 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms