RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PTOV1Q86YD1 416 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PLD3Q8IV08 490 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL4Q8N3J2 472 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT8Q8WV74 236 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VMP1Q96GC9 406 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 POM121Q96HA1 1249 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EGLN2Q96KS0 407 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AIF1LQ9BQI0 150 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DDA1Q9BW61 102 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DGCR6LQ9BY27 220 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2AG1Q9H205 316 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAIMQ9NVQ4 179 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GIN1Q9NXP7 522 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 U3KQV3 271 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PCSK5Q92824 1860 aa6.62□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PRB8 838 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf226A1L170 272 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PIPSLA2A3N6 862 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3D21A4FU49 640 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN24A6NM45 220 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF4O60810 478 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ13O60928 360 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GABARAPO95166 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PCCBP05166 539 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ALOX5P09917 674 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OCM2P0CE71 109 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR89BP0CG08 455 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PNLIPP16233 465 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RHCEP18577 417 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CD22P20273 847 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PCMT1P22061 227 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMB9P28065 219 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SOAT1P35610 550 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GGT2P36268 569 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 STT3AP46977 705 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH9A1P49189 494 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CDC42P60953 191 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OLR1P78380 273 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC35A2P78381 396 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK6Q00534 326 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MC1RQ01726 317 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIBQ01892 262 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE7AQ13946 482 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ERV3-1Q14264 604 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GNA13Q14344 377 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NFATC4Q14934 902 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NR1D2Q14995 579 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MLIPQ5VWP3 458 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM71E1Q6IPT2 247 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf64Q86WR6 236 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.61□□□□□ -1.35
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