RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617087.1

PVT1-225, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 130 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-225	ENST00000617087	SAA4	P35542	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	SPIB	Q01892	262 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GPM6B	Q13491	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	PDK4	Q16654	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	LHX4	Q969G2	390 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	STRADB	Q9C0K7	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PVT1-225	ENST00000617087	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RIPK2	O43353	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	JAK2	O60674	1132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SDC3	O75056	442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CSF2	P04141	144 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ATP6V1C1	P21283	382 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PAX7	P23759	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CA8	P35219	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	METAP1	P53582	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CHIT1	Q13231	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CD226	Q15762	336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		Q7L0L9	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	OSTF1	Q92882	214 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ART5	Q96L15	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		A0A087WYN8	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ASB14	A6NK59	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087		K7ERI5	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	UFL1	O94874	794 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HOXB7	P09629	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RPA2	P15927	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	HAND2	P61296	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SRPX	P78539	464 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NUCB2	P80303	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IL9R	Q01113	521 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BNIP1	Q12981	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TFDP1	Q14186	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	LIME1	Q9H400	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	RARRES3	Q9UL19	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	DHRS7	Q9Y394	339 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PVT1-225	ENST00000617087	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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