RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 GAL3ST3Q96A11 431 aa23.85■■□□□ 1.41
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CAPNS1-204ENST00000587718 DPH1Q9BZG8 443 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC90BQ9GZT6 254 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP4Q9NUV9 329 aa23.85■■□□□ 1.41
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