RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 SSTR4P31391 388 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 MAGEA2P43356 314 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FUT7Q11130 342 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DUSP8Q13202 625 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 NSDHLQ15738 373 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ISXQ2M1V0 245 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 OVCH1Q7RTY7 1134 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 TMEM151BQ8IW70 566 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 BTBD2Q9BX70 525 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 RUBCNLQ9H714 662 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DUSP22Q9NRW4 184 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ERVK-19Q9WJR5 959 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.49■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SERPINB7O75635 380 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SOX30O94993 753 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 H6PDO95479 791 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CAPNS1P04632 268 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ETS2P15036 469 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNF28P17035 718 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 EFNA3P52797 238 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 RAB15P59190 212 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 KCNJ10P78508 379 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 HPCAP84074 193 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 IFI44LQ53G44 452 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 GLRX5Q86SX6 157 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SMYD1Q8NB12 490 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 EME1Q96AY2 570 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FKBP10Q96AY3 582 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 LRFN5Q96NI6 719 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 COL21A1Q96P44 957 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 BDH2Q9BUT1 245 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FOLH1BQ9HBA9 442 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 A8MVJ9 347 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CSO75390 466 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 MFN2O95140 757 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 MT-CO3P00414 261 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CST1P01037 141 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ALBP02768 609 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FABP3P05413 133 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 MAP3K8P41279 467 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 EMDP50402 254 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 COX18Q8N8Q8 333 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 GPR151Q8TDV0 419 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 PMEPA1Q969W9 287 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 FBXL20Q96IG2 436 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR10A5Q9H207 317 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 BAG5Q9UL15 447 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SATB2Q9UPW6 733 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.48■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 A8MUA0 341 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 NKX2-2O95096 273 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 AK1P00568 194 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 HEXBP07686 556 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CDK4P11802 303 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 ITIH1P19827 911 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CLDN6P56747 220 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 MLIPQ5VWP3 458 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 DHRS13Q6UX07 377 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 IZUMO2Q6UXV1 221 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 OLIG3Q7RTU3 272 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SPPL2AQ8TCT8 520 aa15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PACS1-209ENST00000529757 VPS50Q96JG6 964 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms