RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SPPL2AQ8TCT8 520 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RND1Q92730 232 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 KAT2AQ92830 837 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CCT7Q99832 543 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SH3GL2Q99962 352 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TTYH2Q9BSA4 534 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 DOHHQ9BU89 302 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MCM8Q9UJA3 840 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 UTS2RQ9UKP6 389 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACAD8Q9UKU7 415 aa11.93□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TMEM120BA0PK00 339 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SUSD5O60279 629 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TOXO94900 526 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SERPINE1P05121 402 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FGF4P08620 206 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NEFHP12036 1026 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ADH7P40394 386 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CASP3P42574 277 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GSTM5P46439 218 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EMDP50402 254 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RPS6KA2Q15349 733 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR6Y1Q8NGX8 325 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NTNG2Q96CW9 530 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RILPQ96NA2 401 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NODALQ96S42 347 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.92□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 A0A0G2JNJ9 132 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR14I1A6ND48 311 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SLC28A1O00337 649 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GNB5O14775 395 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 BCKDKO14874 412 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 AZIN1O14977 448 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ATP8B1O43520 1251 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC6AO75865 159 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GDF1P27539 372 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PTGDSP41222 190 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TFF3Q07654 80 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACSM2AQ08AH3 577 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EIPR1Q53HC9 387 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SPIN4Q56A73 249 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TMEM198Q66K66 360 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACSM2BQ68CK6 577 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACBD4Q8NC06 268 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OR9A2Q8NGT5 310 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NEIL3Q8TAT5 605 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 HGDQ93099 445 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 OMA1Q96E52 524 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 MECRQ9BV79 373 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 FAIM2Q9BWQ8 316 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ENKD1Q9H0I2 346 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 Q9UFV3 132 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PSME2Q9UL46 239 aa11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C17orf51A8MQB3 221 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NPIPB8E9PQR5 432 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TP53I11O14683 189 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 RGS14O43566 566 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 HCN1O60741 890 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 UGT2B11O75310 529 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PPM1BO75688 479 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CHRNB4P30926 498 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 PTGER4P35408 488 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 NRG3P56975 720 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 CORO7P57737 925 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 C2orf80Q0P641 193 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 IMPG1Q17R60 797 aa11.9□□□□□ -0.5
HPS1-211ENST00000478087 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms