RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 IRGMA1A4Y4 181 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 LRRC72A6NJI9 287 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 FAM227AF5H4B4 570 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 J3QRK9 145 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 M0R3H8 397 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 IGLV3-19P01714 112 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ALPPP05187 535 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 OXA1LQ15070 435 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF404Q494X3 552 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 USP53Q70EK8 1073 aa11.46□□□□□ -0.57
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PTPRF-212ENST00000477970 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRF-212ENST00000477970 ENTPD6O75354 484 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SCG5P05408 212 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 BMP4P12644 408 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 BTN3A2P78410 334 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 INAVAQ3KP66 663 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.46□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 ATCAYQ86WG3 371 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 AMER2Q8N7J2 671 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR4K5Q8NGD3 323 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PMM1Q92871 262 aa11.46□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 EVA1AQ9H8M9 152 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 KCNK12Q9HB15 430 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 POT1Q9NUX5 634 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.46□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 CCRL2O00421 344 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 UGT2B7P16662 529 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MMP11P24347 488 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 AKT2P31751 481 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MC3RP41968 323 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CLDN2P57739 230 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 SRP54P61011 504 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SYT16Q17RD7 645 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 FCRL6Q6DN72 434 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MFSD12Q6NUT3 480 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 OR9A2Q8NGT5 310 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 DIO2Q92813 273 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MSANTD3Q96H12 275 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 RNF44Q7L0R7 432 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 FEN1P39748 380 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 PCYT1AP49585 367 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 ALG11Q2TAA5 492 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 ABHD13Q7L211 337 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 EDAQ92838 391 aa11.45□□□□□ -0.58
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PTPRF-212ENST00000477970 GPR27Q9NS67 375 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ACTR10Q9NZ32 417 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 DAPP1Q9UN19 280 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 A0A087WV62 115 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ISPDA4D126 451 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 MAGEB3O15480 346 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRF-212ENST00000477970 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
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