RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 LBPP18428 481 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 S1PR1P21453 382 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 CRHBPP24387 322 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC1A2P43004 574 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 RFX2P48378 723 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 PITPNBP48739 271 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 FLT3LGP49771 235 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 KLK7P49862 253 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 CXCR4P61073 352 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 OR8G1Q15617 311 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 SVBPQ8N300 66 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 FAF2Q96CS3 445 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 SEC14L3Q9UDX4 400 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 FEM1BQ9UK73 627 aa5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.65□□□□□ -1.5
ECHDC1-215ENST00000475319 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
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ECHDC1-215ENST00000475319 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.65□□□□□ -1.51
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ECHDC1-215ENST00000475319 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.64□□□□□ -1.51
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ECHDC1-215ENST00000475319 SYT5O00445 386 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 MEIS2O14770 477 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 ARPC5O15511 151 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 CHST10O43529 356 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 ORC5O43913 435 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 OR10H2O60403 315 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 PRAMEF4O60810 478 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 WBP4O75554 376 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 RAD17O75943 681 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 LATS1O95835 1130 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 OR52Z1P0C646 297 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 BGNP21810 368 aa5.64□□□□□ -1.51
ECHDC1-215ENST00000475319 FBLN1P23142 703 aa5.64□□□□□ -1.51
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