RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC88CQ9P219 2028 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LILRA5A6NI73 299 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PVRP15151 417 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 GP2P55259 537 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 HPCAP84074 193 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGFQ07326 219 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LACC1Q8IV20 430 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 YIPF4Q9BSR8 244 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 FNDC11Q9BVV2 318 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF226Q9NYT6 803 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 RHCGQ9UBD6 479 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 IFT52Q9Y366 437 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 BLACEA4D250 179 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SOX30O94993 753 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 EPPINO95925 133 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 MT-ND2P03891 347 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CD38P28907 300 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 RAB38P57729 211 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SKP1P63208 163 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ANGPT1Q15389 498 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LTB4RQ15722 352 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 TSSK4Q6SA08 328 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CA13Q8N1Q1 262 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 KAT2AQ92830 837 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PMM1Q92871 262 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC3Q9BQI4 270 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOT13Q9NPJ3 140 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC13A4Q9UKG4 626 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CLCA1A8K7I4 914 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CYR61O00622 381 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 PLOD3O60568 738 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR75O95800 540 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP24386 653 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF311Q5JNZ3 666 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 FHL5Q5TD97 284 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2UQ5VVX9 321 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 PGBD2Q6P3X8 592 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM111BQ6SJ93 734 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 FUNDC2Q9BWH2 189 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL28Q9NXS3 571 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SATB2Q9UPW6 733 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNE3Q9Y6H6 103 aa17.46■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 M0R3H8 397 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 OR10H3O60404 316 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 INMTO95050 263 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 NFATC3Q12968 1075 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC23BQ15437 767 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC35A4Q96G79 324 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 STACQ99469 402 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM131Q92545 1883 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 B4DGG1 531 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 GABARAPO95166 117 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 AK1P00568 194 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 IFNA8P32881 189 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 IDH2P48735 452 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MASP1P48740 699 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ST13P50502 369 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf61Q13536 156 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SLX4IPQ5VYV7 408 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 COMTD1Q86VU5 262 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 OR6T1Q8NGN1 323 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2FQ969M7 185 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 DTNBP1Q96EV8 351 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 COPS4Q9BT78 406 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL25Q9H0H3 589 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGUQ9H490 435 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 EQTNQ9NQ60 294 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 UBXN7O94888 489 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK1P06493 297 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP2-202ENST00000435136 GSTM3P21266 225 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms