RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXD12-201ENST00000404162 FGFBP1Q14512 234 aa17.31■□□□□ 0.36
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HOXD12-201ENST00000404162 C6orf52Q5T4I8 152 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD12-201ENST00000404162 FAM214BQ7L5A3 538 aa17.31■□□□□ 0.36
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HOXD12-201ENST00000404162 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa17.31■□□□□ 0.36
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