RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 LIPGQ9Y5X9 500 aa24.78■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 SLC19A2O60779 497 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 UGT2B11O75310 529 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 PDE9AO76083 593 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 LDLRP01130 860 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 RFPL3SP0C7P2 107 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 HPCAL1P37235 193 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 MAGEA5P43359 124 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 TMED10P49755 219 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF7P61962 342 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 KCNJ2P63252 427 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 PSG6Q00889 435 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 OCRLQ01968 901 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 C3AR1Q16581 482 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 C4orf17Q53FE4 359 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 RIMKLAQ8IXN7 391 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 GHDCQ8N2G8 530 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 TMBIM1Q969X1 311 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 MTERF3Q96E29 417 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 MANSC1Q9H8J5 431 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 IL1RL2Q9HB29 575 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 TINAGQ9UJW2 476 aa24.77■■□□□ 1.56
TPGS1-201ENST00000359315 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 CAPN14A8MX76 684 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ACOX3O15254 700 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 COQ9O75208 318 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SLITRK5O94991 958 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 KITP10721 976 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 FJX1Q86VR8 437 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SLC34A3Q8N130 599 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 DOHHQ9BU89 302 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 VIPAS39Q9H9C1 493 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 MEAF6Q9HAF1 191 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ASIC5Q9NY37 505 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R9Q9NYW1 312 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF835Q9Y2P0 537 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 HRH3Q9Y5N1 445 aa24.76■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 FLNCQ14315 2725 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 A0A1B0GTH9 108 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SDHDO14521 159 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 TP53I11O14683 189 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 GPC1P35052 558 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 CASP3P42574 277 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 RILPQ96NA2 401 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 PLSCR2Q9NRY7 297 aa24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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TPGS1-201ENST00000359315 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
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TPGS1-201ENST00000359315 ACOT7O00154 380 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 NAGAP17050 411 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 PTGDSP41222 190 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 CA7P43166 264 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 MANFP55145 182 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 RBPJQ06330 500 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 HYAL4Q2M3T9 481 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 FNDC7Q5VTL7 733 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ATG16L1Q676U5 607 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 MAVSQ7Z434 540 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 FAM109AQ8N4B1 249 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP28Q8NHY6 868 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 NTNG2Q96CW9 530 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ANGPTL4Q9BY76 406 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 EQTNQ9NQ60 294 aa24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD33BA6NCL7 494 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 TSPAN2O60636 221 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN8P56748 225 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SMU1Q2TAY7 513 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 KIRREL3Q8IZU9 778 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 COQ8BQ96D53 544 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.73■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa24.72■■□□□ 1.55
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa24.72■■□□□ 1.55
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