RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Avl9Q80U56 649 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstm7Q80W21 218 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mblac1Q8BWY4 260 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlgn3Q8BYM5 825 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tgm4Q8BZH1 670 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ift80Q8K057 777 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actr1bQ8R5C5 376 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Impa2Q91UZ5 290 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrc49Q91YK0 686 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Insm2Q9JMC2 493 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aloxe3Q9WV07 711 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creb3l1Q9Z125 519 aa11.97□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5478D3Z6R0 159 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Capns1O88456 269 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tyrp1P07147 537 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gon7P0C8B4 98 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup4P11590 178 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox3P53784 375 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rassf5Q5EBH1 413 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcap31Q61335 245 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zp1Q62005 623 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q810M1 233 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd6Q8CBH5 775 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbx7Q8VDS3 158 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q91W34 466 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bud23Q9CY21 281 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5dQ9D3D9 168 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Socs6Q9JLY0 533 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29106A0A087WSP8 697 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hpse2B2RY83 592 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r106E9PY92 862 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7945F6QI24 236 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5152L7N200 190 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AurkcO88445 282 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IghmP01872 454 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LcatP16301 438 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnb2P30276 398 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apoa1Q00623 264 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp5Q1HL35 384 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk9Q3LS21 402 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpinf2Q61247 491 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ostf1Q62422 215 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lats2Q7TSJ6 1042 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clrn3Q8BHH8 226 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd99l2Q8BIF0 237 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Peli2Q8BST6 419 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PxkQ8BX57 582 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FkrpQ8CG64 494 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1391Q8VFA4 311 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr818Q8VG46 318 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc52a3Q9D6X5 460 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam96aQ9DCL2 160 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr705Q9EPF7 316 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dll4Q9JI71 686 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TescQ9JKL5 214 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mid2Q9QUS6 705 aa11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptges3Q9R0Q7 160 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bod1lE9Q6J5 3032 aa11.96□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16432A0A0A6YXX9 775 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam217bA2AJW5 387 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xlr5bA2BI50 236 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr76A6PWY4 622 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC035947B2RQY6 695 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r12L7N217 831 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lire1P11260 357 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TP20293 436 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serpine1P22777 402 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem38aQ3TMP8 298 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930438A08RikQ5SPH3 536 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pan3Q640Q5 837 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1318Q7TQW6 320 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SynbQ8BI41 618 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl14Q8BID8 400 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa7Q8C3Q5 558 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1317Q8VF84 316 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NpvfQ9ESQ8 188 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Panx1Q9JIP4 426 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd12G5E893 2041 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd14A0A0U1RNG7 287 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndor1A2AI05 598 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp40B1B1D3 796 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrr1D3YY91 422 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp995E9Q6M3 437 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf165E9QAU8 347 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5861F6VCN9 180 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933402N22RikF7D1B3 190 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hnrnpa2b1O88569 353 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b3P70385 305 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nhlh1Q02576 133 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad51Q08297 339 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsk3aQ2NL51 490 aa11.95□□□□□ -0.5
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.1 ms