RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PIGMQ9H3S5 423 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GALNT8Q9NY28 637 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CFL2Q9Y281 166 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MED12Q93074 2177 aa14.94□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GNB5O14775 395 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 HCRTR2O43614 444 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 KLHL2O95198 593 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CYP4B1P13584 511 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DRD5P21918 477 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PPICP45877 212 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CAV1Q03135 178 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GAB1Q13480 694 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FRG2Q64ET8 278 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DESI1Q6ICB0 168 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FBF1Q8TES7 1133 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FRG2BQ96QU4 278 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DPH5Q9H2P9 285 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.93□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 C1orf226A1L170 272 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SH3D21A4FU49 640 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 RAD51CO43502 376 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TNFSF13O75888 250 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CBX7O95931 251 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CRHP06850 196 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 HEXAP06865 529 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GFAPP14136 432 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 STX2P32856 288 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MAGEA4P43358 317 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 LHX2P50458 406 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GNG11P61952 73 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TRAF3Q13114 568 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SLMAPQ14BN4 828 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PRR22Q8IZ63 422 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SPATA4Q8NEY3 305 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 OMA1Q96E52 524 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZNF681Q96N22 645 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TESMINQ9Y4I5 508 aa14.92□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MSTNO14793 375 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 UGT2B11O75310 529 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 KLK1P06870 262 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ZNF708P17019 499 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SRD5A2P31213 254 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 EMDP50402 254 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CLDN18P56856 261 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 BCL2A1Q16548 175 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SLC35A4Q96G79 324 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 COX4I2Q96KJ9 171 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 ITPAQ9BY32 194 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SERHLQ9NQF3 203 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 AHSPQ9NZD4 102 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 PCTPQ9UKL6 214 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 MED12LQ86YW9 2145 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 B4DXG7 233 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 STX16O14662 325 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 SIAH2O43255 324 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 KRT15P19012 456 aa14.9□□□□□ -0.02
CLN3-255ENST00000637100 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms