RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253 SMPD2O60906 423 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 RCBTB2O95199 551 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 LY6G6DO95868 133 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 KLK1P06870 262 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FREM3P0C091 2139 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CPMP14384 443 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CPN1P15169 458 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 STARP49675 285 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 IRF9Q00978 393 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GTF2H2Q13888 395 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 TRADDQ15628 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SLC30A6Q6NXT4 461 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SMPDL3BQ92485 455 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 OMA1Q96E52 524 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ARSGQ96EG1 525 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 NODALQ96S42 347 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SERPINI1Q99574 410 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FETUBQ9UGM5 382 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 DNHD1Q96M86 4753 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 VPS13CQ709C8 3753 aa14.73□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SNPHO15079 494 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 UGDHO60701 494 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CBR3O75828 277 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 NAGAP17050 411 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CNTFP26441 200 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PCSK6P29122 969 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 DIO3P55073 304 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GUCY2DQ02846 1103 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 IFNEQ86WN2 208 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ZNF592Q92610 1267 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 WNT2BQ93097 391 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CDK15Q96Q40 435 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ITPAQ9BY32 194 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PIGMQ9H3S5 423 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 A0A087X1B8 175 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CCDC189A1A4V9 331 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 H7C1Q1 480 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CLDN9O95484 217 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GAB1Q13480 694 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 SGO1Q5FBB7 561 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 HGDQ93099 445 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PIGTQ969N2 578 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 AHSPQ9NZD4 102 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 CFL2Q9Y281 166 aa14.71□□□□□ -0.05
CD99-211ENST00000623253 PRAMEF25A6NGN4 478 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 A8MXE2 369 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 UGT2B11O75310 529 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SEMA3DO95025 777 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 C2P06681 752 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 S1PR1P21453 382 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 PTGDSP41222 190 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MAPK12P53778 367 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SLC7A5Q01650 507 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 SNTA1Q13424 505 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 MROH9Q5TGP6 573 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 C8orf74Q6P047 294 aa14.7□□□□□ -0.06
CD99-211ENST00000623253 AAGABQ6PD74 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms