RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 LTBQ06643 244 aa20.16■□□□□ 0.82
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SRRT-218ENST00000620394 DUSP8Q13202 625 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 RASA2Q15283 850 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 UNC50Q53HI1 259 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TMEM198Q66K66 360 aa20.16■□□□□ 0.82
SRRT-218ENST00000620394 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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SRRT-218ENST00000620394 C15orf41Q9Y2V0 281 aa20.16■□□□□ 0.82
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SRRT-218ENST00000620394 PRR22Q8IZ63 422 aa20.13■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 ZNF675Q8TD23 568 aa20.13■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.13■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.12■□□□□ 0.81
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SRRT-218ENST00000620394 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 IFT20Q8IY31 132 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 MZB1Q8WU39 189 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 TIMP4Q99727 224 aa20.12■□□□□ 0.81
SRRT-218ENST00000620394 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.12■□□□□ 0.81
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