RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 NNATQ16517 81 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 FAM111BQ6SJ93 734 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 NODALQ96S42 347 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 MAT2BQ9NZL9 334 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF639Q9UID6 485 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 PCTPQ9UKL6 214 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRF-216ENST00000617451 ABCA2Q9BZC7 2435 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf226A1L170 272 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SNPHO15079 494 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ICOSLGO75144 302 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1B1P05026 303 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PTGDSP41222 190 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO1A2P46721 670 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SNTA1Q13424 505 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB113Q30KQ7 82 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OMA1Q96E52 524 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ITPAQ9BY32 194 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT9Q9HCQ5 603 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TMCO1Q9UM00 188 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf72A6NCS6 295 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 STX16O14662 325 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ACOX3O15254 700 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GUCY1B2O75343 617 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GOSR1O95249 250 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 RBP1P09455 135 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CYP4B1P13584 511 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 FEN1P39748 380 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 FOXF2Q12947 444 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 KEAP1Q14145 624 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SGO1Q5FBB7 561 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 MMP21Q8N119 569 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SIMC1Q8NDZ2 872 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TUBA1CQ9BQE3 449 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SERHLQ9NQF3 203 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CLCA1A8K7I4 914 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B11O75310 529 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CBX7O95931 251 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GCKP35557 465 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PLCXD2Q0VAA5 305 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 WDSUB1Q8N9V3 476 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 OR2B2Q9GZK3 357 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 KLRF1Q9NZS2 232 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SLC12A4Q9UP95 1085 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ESYT3A0FGR9 886 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ERN1O75460 977 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CBR3O75828 277 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 RCBTB2O95199 551 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DRD5P21918 477 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 CNTFP26441 200 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA12P43365 314 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ISL2Q96A47 359 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 ZFP3Q96NJ6 502 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 UCN2Q96RP3 112 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 TM9SF2Q99805 663 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SFXN3Q9BWM7 321 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 EHD3Q9NZN3 535 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 XPR1Q9UBH6 696 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PSME2Q9UL46 239 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PLLPQ9Y342 182 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1B0GTL3 188 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 SMIM24O75264 130 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PHBP35232 272 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 PPICP45877 212 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 EMDP50402 254 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF7P61962 342 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRF-216ENST00000617451 DUSP2Q05923 314 aa22.66■■□□□ 1.22
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