RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ACP2P11117 423 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ACPPP15309 386 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 DDCP20711 480 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ITGA3P26006 1051 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 28.6
PTPRM-205ENST00000577827 LIPAP38571 399 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ZXDBP98169 803 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SLX4IPQ5VYV7 408 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TEX37Q96LM6 180 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 PINK1Q9BXM7 581 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 A8MU76 341 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SLC43A1O75387 559 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CHRNB1P11230 501 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 PLK5Q496M5 336 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 C3orf38Q5JPI3 329 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SBSNQ6UWP8 590 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TPRA1Q86W33 373 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 MAFFQ9ULX9 164 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 OR5H6Q8NGV6 325 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TMEM163Q8TC26 289 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 ALX3O95076 343 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 37.2
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PTPRM-205ENST00000577827 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 KAT7O95251 611 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 DBIP07108 87 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
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