RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PELI3Q8N2H9 469 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 GALNT16Q8N428 558 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SLC25A41Q8N5S1 370 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 BCORP1Q8N888 145 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC18CQ8NCF0 446 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 BBOF1Q8ND07 529 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TTLQ8NG68 377 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC110Q8TBZ0 833 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PATE1Q8WXA2 126 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 METTL21AQ8WXB1 218 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SMPDL3AQ92484 453 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 EME1Q96AY2 570 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CHP1Q99653 195 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 HAUS8Q9BT25 410 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 H2AFJQ9BTM1 129 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CAPS2Q9BXY5 557 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM2Q9C040 744 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 LHPPQ9H008 270 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CHST11Q9NPF2 352 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM184CQ9NVA4 438 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ARL5AQ9Y689 179 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 NUP210LQ5VU65 1888 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.96□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM10O14672 748 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF749O43361 778 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MTX2O75431 263 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 BMP10O95393 424 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 EML2O95834 649 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 AGTP01019 485 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 C8GP07360 202 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 UQCRHP07919 91 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PIRTP0C851 137 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MPC1LP0DKB6 136 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ERGP11308 486 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TNNT1P13805 278 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 UGT2B7P16662 529 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CAPN3P20807 821 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 UGT1A1P22309 533 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ACADLP28330 430 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SERPINB1P30740 379 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 FOXN2P32314 431 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 HNMTP50135 292 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF75DP51815 510 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CTSCP53634 463 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PSPHP78330 225 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 POU6F1Q14863 301 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 HERC3Q15034 1050 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.785e-8■■■■□ 21.4
HDAC2-216ENST00000523628 OASLQ15646 514 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 RBBP7Q16576 425 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PHKG1Q16816 387 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MIDNQ504T8 468 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CASC4Q6P4E1 433 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SLC22A25Q6T423 547 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 GPSM1Q86YR5 675 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 POGLUT1Q8NBL1 392 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 MCUQ8NE86 351 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 PERPQ96FX8 193 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 RMDN2Q96LZ7 410 aa3.95□□□□□ -1.78
HDAC2-216ENST00000523628 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.95□□□□□ -1.78
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