RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	TCP11	Q8WWU5	503 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SMPDL3A	Q92484	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HSD17B8	Q92506	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PCED1B	Q96HM7	432 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CITED1	Q99966	193 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP58	Q9BVL2	599 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IL25	Q9H293	177 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FANCE	Q9HB96	536 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB18	Q9NP72	206 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GDF3	Q9NR23	364 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WNT16	Q9UBV4	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP45	Q9UL16	551 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF175	Q9Y473	711 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FKBP7	Q9Y680	259 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		3.55	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3C2G	O75747	1445 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPOAP1	O95153	1857 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0U1RQS6	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC30	A6NM36	301 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	WRB	O00258	174 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CLDN5	O00501	218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SH2D1B	O14796	132 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF11	O14901	512 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRTM2	O43300	516 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNG3	O60359	315 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ANXA9	O76027	345 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PMS2P2	O95744	297 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IGKV3-20	P01619	116 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CDH1	P12830	882 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HLA-DOB	P13765	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PSMA2	P25787	234 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SYK	P43405	635 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HTR5A	P47898	357 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PPT1	P50897	306 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GAS1	P54826	345 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HAND2	P61296	217 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPK6	Q16659	721 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702		Q6ZRG5	221 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC43	Q8N309	656 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC185	Q8N715	623 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RDH11	Q8TC12	318 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	RAPGEF5	Q92565	580 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	P3H4	Q92791	437 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	GSDMA	Q96QA5	445 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SGK2	Q9HBY8	427 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	SUN2	Q9UH99	717 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		3.54	□□□□□ -1.84
FAM49B-222	ENST00000522702	POMT2	Q9UKY4	750 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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