RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CD58P19256 250 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SRMP19623 302 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 LMO2P25791 158 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CEBPGP53567 150 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 UCNP55089 124 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F1Q01094 437 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS1Q08116 209 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 OVGP1Q12889 678 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 CSHL1Q14406 222 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 VWA1Q6PCB0 445 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CYHR1Q6ZMK1 362 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC19Q96DA6 116 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 APIPQ96GX9 242 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ST6GAL2Q96JF0 529 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DOK1Q99704 481 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SEMA3CQ99985 751 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 HMG20AQ9NP66 347 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 POLE4Q9NR33 117 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 MKLN1Q9UL63 735 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR179Q6PRD1 2367 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ARID2Q68CP9 1835 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 CALCAP01258 141 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 PCCBP05166 539 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 C1QTNF9P0C862 333 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 IL7P13232 177 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 HLA-EP13747 358 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 IFNGR1P15260 489 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF30P17039 623 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 GXYLT1Q4G148 440 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 MRNIPQ6NTE8 343 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 PET117Q6UWS5 81 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SNX29P2Q8IUI4 249 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA6LQ8N4H0 392 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 DEDD2Q8WXF8 326 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ALG14Q96F25 216 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 FAHD2AQ96GK7 314 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 VAT1Q99536 393 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CSTL1Q9H114 145 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 EQTNQ9NQ60 294 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGGTB-213ENST00000496055 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 HIF3AQ9Y2N7 669 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0C4DFX4 3053 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 COL6A3P12111 3177 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa4.32□□□□□ -1.72
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