RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFAND2BQ8WV99 257 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGNO76038 276 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN2P57739 230 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ARPC4P59998 168 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP19Q14CB8 494 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD11Q693B1 232 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 Q6ZSR6 202 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MGAT4AQ9UM21 535 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 H3BQ06 376 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ARNTLO00327 626 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTM2P28161 218 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PPK0 400 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 STOMP27105 288 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A11P48066 632 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CEBPGP53567 150 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SGCAQ16586 387 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CPZQ66K79 652 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ASB11Q8WXH4 323 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MNTQ99583 582 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ANTXRLA6NF34 631 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OSMP13725 252 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ACVR1BP36896 505 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC41A3Q96GZ6 507 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FANCFQ9NPI8 374 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3D21A4FU49 640 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 JRKO75564 520 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PCGF2P35227 344 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MTNR1AP48039 350 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FUNDC2Q9BWH2 189 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRAMEF2O60811 474 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MC3RP41968 323 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP8Q14114 963 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OCLNQ16625 522 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMA3DO95025 777 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MICAQ29983 383 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SPERTQ8NA61 448 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF480Q8WV37 535 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1F2PQ96R84 312 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC30A3Q99726 388 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CD207Q9UJ71 328 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PER3P56645 1201 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CDRT4Q8N9R6 151 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52E2Q8NGJ4 325 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC29A1Q99808 456 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RXFP3Q9NSD7 469 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MROH6A6NGR9 719 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 M0R3H8 397 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNGR4O95473 234 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PRLHRP49683 370 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 KIR2DS3Q14952 304 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 MYLIPQ8WY64 445 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SGCDQ92629 289 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 RFT1Q96AA3 541 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 LPAR4Q99677 370 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 29.1
PTPRJ-201ENST00000418331 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 GPR89BP0CG08 455 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTA2P62736 377 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTG2P63267 376 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINA11Q86U17 422 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5C3BQ969T7 300 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 FXYD6Q9H0Q3 95 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRJ-201ENST00000418331 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms