RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346501.8

TSPAN4-201, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TSPAN4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-201ENST00000346501 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 METTL7AQ9H8H3 244 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZFP64Q9NPA5 681 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 FLNCQ14315 2725 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 A0A1B0GTH9 108 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 A1L4Q6 167 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ANKRD33BA6NCL7 494 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 FRG2CA6NGY1 282 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 LSM1O15116 133 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PDPK1O15530 556 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ABCB7O75027 752 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PPM1BO75688 479 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 CBX7O95931 251 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ABCD3P28288 659 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PTGER1P34995 402 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 HPCAL1P37235 193 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 FBXW4P57775 412 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MGAT2Q10469 447 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 KIAA0040Q15053 153 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 CEBPEQ15744 281 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 NNATQ16517 81 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 C3AR1Q16581 482 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 LYPD8Q6UX82 237 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM64Q6YI46 380 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 Q6ZSR9 355 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PRR22Q8IZ63 422 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 LIX1Q8N485 282 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TUBGCP3Q96CW5 907 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TMCO6Q96DC7 493 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MTERF3Q96E29 417 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PKNOX2Q96KN3 472 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TSSK3Q96PN8 268 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 REEP4Q9H6H4 257 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 QPCTLQ9NXS2 382 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TINAGQ9UJW2 476 aa14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 A0A087WV62 115 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM233B4DJY2 109 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 AKAP10O43572 662 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZG16O60844 167 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PEX11AO75192 247 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 REM1O75628 298 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ATP6AP2O75787 350 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PRPS2P11908 318 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SDC1P18827 310 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 IL12BP29460 328 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 GCKP35557 465 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MAGEA5P43359 124 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MAN2A2P49641 1150 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 EMDP50402 254 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 HSF1Q00613 529 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 DUSP2Q05923 314 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 STX3Q13277 289 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 EFR3AQ14156 821 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC34A3Q8N130 599 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 NATD1Q8N6N6 113 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 OR2T11Q8NH01 316 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SPPL2AQ8TCT8 520 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SARAFQ96BY9 339 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 OMA1Q96E52 524 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 SH2D2AQ9NP31 389 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PTPN13Q12923 2485 aa14.49□□□□□ -0.09
TSPAN4-201ENST00000346501 PINLYPA6NC86 204 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms