RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SLC38A1Q9H2H9 487 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 E9PQ18 207 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 FOXS1O43638 330 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SETD9Q8NE22 299 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 LIPT1Q9Y234 373 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 FCMRO60667 390 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ATP1B1P05026 303 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CT62P0C5K7 136 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ACP2P11117 423 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 POU2F1P14859 743 aa16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 COLEC12Q5KU26 742 aa16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 CEPT1Q9Y6K0 416 aa16.74■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 TLCD2A6NGC4 264 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 LGI1O95970 557 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZNF773Q6PK81 442 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.73■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 TAGAPQ8N103 731 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PITX2Q99697 317 aa16.73■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 PINK1Q9BXM7 581 aa16.73■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 A8MVJ9 347 aa16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 GIMD1P0DJR0 217 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CBLP22681 906 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 FMO3P31513 532 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CTSKP43235 329 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 EPHA4P54764 986 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PIGFQ07326 219 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 KCNAB1Q14722 419 aa16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 NDUFA9Q16795 377 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 SYT16Q17RD7 645 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZNF311Q5JNZ3 666 aa16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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ACTB-201ENST00000331789 PEX11GQ96HA9 241 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PSD2Q9BQI7 771 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PDE7BQ9NP56 450 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CALML5Q9NZT1 146 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 DSPPQ9NZW4 1301 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 H1F0P07305 194 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 GSSP48637 474 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 CFHR1Q03591 330 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 PMS2P3Q13401 168 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTB-201ENST00000331789 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
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