RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata6Q3U6K5 488 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HgsnatQ3UDW8 656 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem151aQ6GQT5 468 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp324Q78F42 583 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr835Q7TRG7 311 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RinlQ80UW3 563 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vrk2Q8BN21 503 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 UstQ8BUB6 407 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxl3Q8C4V4 428 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Obp2aQ8K1H9 176 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdelr3Q8R1L4 214 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r218Q8R261 298 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r24Q8R2D6 296 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mib2Q8R516 973 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1330Q8VEY6 315 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr24Q8VFM9 313 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbms1Q91W59 403 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nipsnap3bQ9CQE1 247 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LrmdaQ9D9B4 229 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ift22Q9DAI2 185 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emc7Q9EP72 241 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dgcr8Q9EQM6 773 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrm3Q9ERZ3 589 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ing2Q9ESK4 281 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufaf3Q9JKL4 185 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dkk3Q9QUN9 349 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AgtrapQ9WVK0 161 aa10.33□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nav2E9Q842 2432 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ssxb6A2BI74 170 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14139F6ZS36 494 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H3BKT1 185 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r36K7N741 852 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc27a2O35488 620 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nfkbil1O88995 381 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csf1P07141 552 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PcnaP17918 261 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wt1P22561 449 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc19a1P41438 512 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Map3k7clP58500 142 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctps2P70303 586 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gfi1P70338 423 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dgcr2P98154 548 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankdd1bQ14DN9 521 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pate2Q3UW31 111 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fzd7Q61090 572 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd55Q61475 390 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OgnQ62000 298 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlx3Q64205 287 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gga2Q6P5E6 603 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1036Q7TR85 310 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rcn2Q8BP92 320 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lix1lQ8BQ89 337 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc134Q8C7V8 229 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pramef8Q8CE24 480 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan10Q8VCF5 331 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neurl1Q923S6 574 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Unc50Q9CQ61 259 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aar2Q9D2V5 384 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oma1Q9D8H7 521 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AvenQ9D9K3 342 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DAS2 200 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nectin1Q9JKF6 515 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpc4apQ9JLV2 797 aa10.32□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr839-ps1A0A1D5RMH6 312 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5938A2AEN9 163 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AgmatA2AS89 358 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itih4A6X935 942 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PiggD3Z3Y1 983 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6811E9Q3Y8 510 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21319F6YNI8 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr1b10G5E895 316 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm5039J3QNT6 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccrl2O35457 360 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl2a1dO55179 172 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn1O88551 211 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BrafP28028 804 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif2aP28740 705 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VdrP48281 422 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S100bP50114 92 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rgs14P97492 547 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Meaf6Q2VPQ9 191 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2410002F23RikQ3TE80 284 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm2016Q3TQZ4 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8332Q3UTA4 144 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itgb2lQ3UV74 738 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chsy3Q5DTK1 884 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hs3st6Q5GFD5 342 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav6-2Q5R1I4 113 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr3Q60879 313 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlx2Q61663 284 aa10.31□□□□□ -0.76
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rslcan18Q7M6X5 460 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms