RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GPX3P22352 226 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RPP38P78345 283 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 LTBQ06643 244 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXF2Q12947 444 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2H2Q13888 395 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NNATQ16517 81 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 BIVMQ86UB2 503 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 L3MBTL4Q8NA19 623 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf47Q8NEP4 570 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FBF1Q8TES7 1133 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM187AA6NFU0 413 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 HRGP04196 525 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5EP21589 574 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF7P61962 342 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RCAN2Q14206 197 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.335e-62■■□□□ 12.6
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K14Q8NGD5 310 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1J4Q8NGS1 313 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ZPLD1Q8TCW7 415 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK15Q96Q40 435 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA1CQ9BQE3 449 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL7AQ9H8H3 244 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FETUBQ9UGM5 382 aa23.37■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD51CO43502 376 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3DO95025 777 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GOSR1O95249 250 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT15P19012 456 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CD53P19397 219 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 S1PR1P21453 382 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGDSP41222 190 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 XKP51811 444 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXDC2Q6UX71 529 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7G1Q8NGA0 311 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC44A1Q8WWI5 657 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 HGDQ93099 445 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C18orf12Q96KH6 178 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NODALQ96S42 347 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT9Q9HCQ5 603 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GALNT8Q9NY28 637 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FREM3P0C091 2139 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087X1B8 175 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf72A6NCS6 295 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SNPHO15079 494 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ERN1O75460 977 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PPM1BO75688 479 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTL6AO96019 429 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C2P06681 752 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP4B1P13584 511 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CPMP14384 443 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 STX2P32856 288 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf163Q5TEZ5 329 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 LUZP2Q86TE4 346 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINI1Q99574 410 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPAQ9BY32 194 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF14Q9UBS8 474 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA2Q9BZC7 2435 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 HMX2A2RU54 273 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7A17O14581 309 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK1P06870 262 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CPN1P15169 458 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAP2Q15057 778 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM81Q6P7N7 255 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC25Q86WR0 208 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 VWA5B2Q8N398 1253 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52B6Q8NGF0 335 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 DACH2Q96NX9 599 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SFXN3Q9BWM7 321 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL11Q9BXB4 747 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SERHLQ9NQF3 203 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPRE3Q9UPY8 281 aa23.34■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ICOSLGO75144 302 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH16O75309 829 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN9O95484 217 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 INHBBP09529 407 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NAGAP17050 411 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA4P43358 317 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 PLTPP55058 493 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT2Q10469 447 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 NAB1Q13506 487 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 MROH9Q5TGP6 573 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM111BQ6SJ93 734 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 SIMC1Q8NDZ2 872 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 OMA1Q96E52 524 aa23.33■■□□□ 1.33
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR78Q96P69 363 aa23.33■■□□□ 1.33
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