RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	AMER3	Q8N944	861 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TP53I13	Q8NBR0	393 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SMARCD2	Q92925	531 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		17.36	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JN53	185 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SYT5	O00445	386 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	NR2F6	P10588	404 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CASP3	P42574	277 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PRR5	P85299	388 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	EFNB1	P98172	346 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	BNC1	Q01954	994 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	RAB40B	Q12829	278 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PDGFRL	Q15198	375 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ZIC1	Q15915	447 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SNAPC1	Q16533	368 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	UCN3	Q969E3	161 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ASB16	Q96NS5	453 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CHRM4	P08173	479 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	IFNA8	P32881	189 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GJA8	P48165	433 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PRKAG1	P54619	331 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PSPH	P78330	225 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ABAT	P80404	500 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLAMF1	Q13291	335 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP6	Q5VW22	663 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	COMTD1	Q86VU5	262 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP4	Q96P64	663 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		17.35	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM129	A0AVI4	362 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	STK25	O00506	426 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PRODH	O43272	600 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ACP2	P11117	423 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ACP5	P13686	325 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PKLR	P30613	574 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	AHR	P35869	848 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM23	P36406	574 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	WNT4	P56705	351 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CAMK1	Q14012	370 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	KRT33B	Q14525	404 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GPR19	Q15760	415 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP6	Q16828	381 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GPAT3	Q53EU6	434 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM163	Q8TC26	289 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	ASB15	Q8WXK1	588 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	OR2A14	Q96R47	310 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CTRC	Q99895	268 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CALML5	Q9NZT1	146 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		17.34	■□□□□ 0.37
RRN3-205	ENST00000563559	CMAHP	Q9Y471	501 aa		17.34	■□□□□ 0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms