RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXW4	P57775	412 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNJ2	P63252	427 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS6KA2	Q15349	733 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RDH11	Q8TC12	318 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NTNG2	Q96CW9	530 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SMC6	Q96SB8	1091 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		20.01	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CAPN14	A8MX76	684 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	AQP7	O14520	342 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6AP2	O75787	350 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCD3	P28288	659 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC10A1	Q14973	349 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GXYLT1	Q4G148	440 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RPRML	Q8N4K4	120 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		20	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BQF6	201 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf84	I3L1E1	186 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	COPE	O14579	308 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LRAT	O95237	230 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CPA3	P15088	417 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LTB4R	Q15722	352 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CEBPE	Q15744	281 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF675	Q8TD23	568 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	DIO2	Q92813	273 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CFL2	Q9Y281	166 aa		19.99	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PDZD2	O15018	2839 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53I11	O14683	189 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	HCN1	O60741	890 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT17	P0C025	328 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EMD	P50402	254 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NRG3	P56975	720 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	VSNL1	P62760	191 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	DOHH	Q9BU89	302 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ITPA	Q9BY32	194 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EHD3	Q9NZN3	535 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PLLP	Q9Y342	182 aa		19.98	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	POLQ	O75417	2590 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BCKDK	O14874	412 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PCSK2	P16519	638 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	NAGA	P17050	411 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BTK	Q06187	659 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR22	Q8IZ63	422 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EBPL	Q9BY08	206 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MKS1	Q9NXB0	559 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		19.97	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP3	P42574	277 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTM5	P46439	218 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN2A2	P49641	1150 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP157	Q5JU67	520 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPM	Q5VYY2	423 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		19.96	■□□□□ 0.79

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