RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 S4R3C0 116 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRP4O75096 1905 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANGPTL7O43827 346 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 DDX58O95786 925 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CSN3P07498 182 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 STSP08842 583 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSMC3P17980 439 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 GABRB1P18505 474 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 DUTP33316 252 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPBWR1P48145 328 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERFP50548 548 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SULT2A1Q06520 285 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRC36Q1X8D7 754 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SUSD4Q5VX71 490 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX38Q6PEX7 206 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1orf228Q6PIY5 440 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 APOOLQ6UXV4 268 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF730Q6ZMV8 503 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 OTOAQ7RTW8 1153 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR141Q7Z602 305 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C9orf40Q8IXQ3 194 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM104Q8NE00 496 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR1P1Q8NH06 330 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SYNPRQ8TBG9 265 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 HVCN1Q96D96 273 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C17orf62Q9BQA9 187 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SULT4A1Q9BR01 284 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCM2Q9BSQ5 444 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSSK1BQ9BXA7 367 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 DPEP2Q9H4A9 486 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALG9Q9H6U8 611 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 NRBP1Q9UHY1 535 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDH9Q9ULB4 789 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLAGL1Q9UM63 463 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 YEATS2Q9ULM3 1422 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHRS7CA6NNS2 312 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 YDJCA8MPS7 323 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPHP1O15259 732 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SOCS1O15524 211 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 P2RX6O15547 441 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 EFNA2O43921 213 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TOMM70O94826 608 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYL1P05976 194 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 RB1P06400 928 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 EPORP19235 508 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 IDSP22304 550 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 HSD17B3P37058 310 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ID1P41134 155 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRKLP46109 303 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF83P51522 516 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM14Q14142 442 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 NSDHLQ15738 373 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 STK11Q15831 433 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAF3Q5VWG9 929 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR5M10Q6IEU7 315 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 COX15Q7KZN9 410 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCP2Q8IVA1 136 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC146Q8IYE0 955 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 MCHR2Q969V1 340 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PERPQ96FX8 193 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 C8orf48Q96LL4 319 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRAM1Q96QH2 718 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM129AQ9BZQ8 928 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SGK2Q9HBY8 427 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLCB1Q9NQ66 1216 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFT52Q9Y366 437 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 POMT1Q9Y6A1 747 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV18A0A075B6X5 111 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC100509620A0A075B734 347 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 H3BMM5 538 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADAM12O43184 909 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYNP07948 512 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 ALPIP09923 528 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLULP15104 373 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 NSFP46459 744 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 APOC4P55056 127 aa-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms